Cílem programu Počítačová lingvistika (dříve obor Český jazyk se specializací počítačová lingvistika) je propojit humanitní a přírodovědné vzdělání a poskytnout studentům náhled do obou těchto světů. Program se zaměřuje na výchovu lingvistů s kvalitní znalostí českého jazyka, s kvalifikovaným vhledem do oblasti informačních technologií a schopností algoritmického myšlení. Je určen studentům, které láká hledat průniky zdánlivě neslučitelných disciplín, jako jsou lingvistika a informatika. V České republice jde o jediný program na humanitně orientované fakultě, ve kterém lze studovat počítačovou lingvistiku již v bakalářském stupni. Program je propojen s organizacemi a firmami jihomoravského regionu, ve kterých studenti nacházejí uplatnění již během studia. Kromě studia českého jazyka, informatiky a počítačové lingvistiky nabízí program řadu dalších aktivit, jako jsou přednášky zvaných hostů, exkurze na akademická a komerční pracoviště, účast v zajímavých projektech a odborné workshopy (vlastní či ve spolupráci s firmami).
V letech 2012–2014 byl obor podporován projektem OP VK – INOVA.CZ.